Cátedra Simón Bolívar en e-Ciencia
La Cátedra Simón Bolívar 2006 en e-Ciencia está destinada a promover en Venezuela todos los aspectos relacionados con la ciencia computacionalmente intensiva. La Cátedra está patrocinada por la Fundación Venezolana de Promoción del Investigador (FVPI), y cuenta con el auspicio de CeCalCULA, CEMVICC (UC) y del Laboratorio de Inmunoparasitología del IVIC.
Acerca de mí

- Nombre: Claudio Mendoza
- Ubicación: Caracas, Venezuela
Físico, Investigador Titular del IVIC
16.4.07
Física atómica computacional en el ambiente de e-Ciencia
Curso sobre Interacciones Huésped-Parásito y Biología de Vectores
Durante la quincena del 04-15 de septiembre de 2006 se llevó a cabo el curso "Interacciones Huésped-Parásito y Biología de Vectores".Ducho curso fue designado para introducir a los estudiantes de postgrado el conocimiento actual sobre las interacciones huésped-parásito en las enfermedades transmitidas por vectores. Se enfocó en la biología celular de los parásitos, en los mecanismos genéticos e inmunológicos de sobrevivencia y en el diagnóstico del parásito. Los tópicos que se consideraron incluyeron mecanismos de invasión de la célula del huésped, repuestas inmunes innatas y adaptativas del huésped, estructura y expresión genómica del parásito y las interacciones vector-parásito. Se les dio considerable atención a las aplicaciones de herramientas de bioinformática y sistemas de información geográfica en este campo. Se enfatizó a los parásitos que causan problemas de salud en los países del Caribe. Por lo tanto el curso fue destinado a estudiantes de la cuenca del Caribe y América Central, y tuvo una duración de dos semanas de trabajo intensivo, juxtaponiendo conferencias diarias con prácticas de laboratorio tanto en español como en inglés. El curso usó las salas de conferencias, laboratorios, instalaciones computacionales y residencias del Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas (IVIC) en Caracas.
La Cátedra Simón Bolívar 2006 en e-Ciencia tomó parte activa en la organización de este curso, sobre todo en la coordinación de las secciones de bioinformática (junto con CeCalCULA), sistemas de información geográfica (junto con la UCV) y en las ocho videoconferencias (junto con la Unidad de Computación del IVIC) que se impartieron. También Claudio Mendoza dictó el 15-09-06 la charla "e-Ciencia: buscando a Kepler".
Estructura del curso
- Parasitismo y enfermedad
- Patógenos y vectores
- Enfoques moleculares para el entendimiento de la biología del parásito y de las interacciones huésped-parásito
- Bioinformática y sistemas de información geográfica aplicados a enferemedades parasíticas
Comité Organizador
- Ananías Escalante (ASU, USA. ananias.escalante@asu.edu)
- Alexis Mendoza-León (IBE/UCV, Venezuela. amendozaleon@hotmail.com)
- Claudio Mendoza (IVIC, Venezuela. claudio@ivic.ve)
- Hilda A. Pérez (IVIC, Venezuela. hperez@ivic.ve)
- José Luís Ramírez (IDEA/USB, Venezuela. jramirez@reacciun.ve)
- Steven G. Reed (Corixa Corp./IDRI, USA, reed@corixa.com)
- Félix J. Tapia (IB/UCV, Venezuela. felix.tapia@gmail.com)
- Julio A. Urbina (IVIC, Venezuela. jurbina@imac.com)
Estudiantes participantes
- Rocío Cardenas (Colombia. rocicardenas@gmail.com)
- Melvin Challenger (Dominica. challengermelvin@hotmail.com)
- Ester Durrego (Venezuela. escaduga@gmail.com)
- Nilsa Elizabeth González (Venezuela. lizzybritez@yahoo.com)
- Radha Gosein (Trinidad/Tobago. goseinra@carec.paho.org)
- Laura María Grajeda (Guatemala. lmgrajeda@gmail.com)
- Fabiola Adela León Miranda (Venezuela. fleon@ivic.ve)
- Claudia Marisol Machuca (Venezuela. cmmr79@yahoo.com)
- Carlos Enrique Muskus (Colombia. carmusk@yahoo.com)
- Suemin Nathaniel-Girdharrie (Trinidad/Tobago. nathansu@carec.paho.org)
- José Robinson Ramírez Pineda (Colombia. ramirezpineda@guajiros.udea.edu.co)
- Jinnay Rodríguez Rodríguez (Cuba. jinnay@ipk.sld.cu)
- Xenón Alberto Serrano Martín (Venezuela. xenon_serrano@hotmail.com)
- Luis David Ureña (Panamá. urenal@si.edu)
- José Ramón Vielma (Venezuela. joravig@yahoo.com)
Conferencistas
- Roberto Barrera (CDC, Pto. Rico. amz9@cdc.gov)
- Carmen Bracho (IVIC, Venezuela. cbracho@ivic.ve)
- Maira Cabrera (IB/UCV, Venezuela. mairacab@gmail.com)
- Nardy Diez (IDEA, Venezuela. ndiez@idea.org.ve)
- Dora Feliciangeli (UC, Venezuela. mdora@movistar.net.ve)
- Iván Galindo (IDEA, Venezuela. igalindo@idea.gob.ve)
- María Eugenia Grillet (UCV, Venezuela. mgrillet@ciens.ucv.ve)
- Renato Gusmao (PAHO. gusmaore@ven.ops-oms.org)
- Juan Martínez (UCV, Venezuela. juaneudes22@yahoo.com)
- Alexis Mendoza-León (IBE/UCV, Venezuela. amendoza50@gmail.com)
- Claudio Mendoza (IVIC y Cátedra Simón Bolívar, Venezuela. claudio@ivic.ve)
- Walter Mosca (UCV, Venezuela. wmosca@gmail.com)
- Hilda A. Pérez (IVIC, Venezuela. hperez@ivic.ve)
- José Luis Ramírez (IDEA, Venezuela. jramirez@reacciun.ve)
- Steven G. Reed (Corixa Corp/IDRI, USA. reed@corixa.com)
- Noris Rodríguez(IB/UCV, Venezuela. nrodri@movistar.net.ve)
- Ascanio Rojas (IVIC, Venezuela. ascrojas@ivic.ve)
- José David Rosales (CeCalCULA, Venezuela. joser@cecalc.ula.ve)
- Martín Sánchez (IB/UCV, Venezuela. martinsanchez1@gmail.com)
- José V. Scorza (ULA, Venezuela. jvscorz@yahoo.com)
- Félix J. Tapia (IB/UCV, Venezuela. felix.tapia@gmail.com)
- Jaime Torres (UCV, Venezuela. jaimerafael.torres@gmail.com)
Videoconferencias
- Edmundo Calva (ASM/UNAM, México. ecalva@ibt.unam.mx)
- Rita Colwell (UMIACS, USA. rcolwell@umiacs.umd.edu)
- Ananías Escalante (ASU, USA. ananias.escalante@asu.edu)
- Stephen L. Hoffman (Sanaria Inc, USA. Mhenry@sanaria.com)
- Fotis Kafatos (Imperial College, UK. d.h.green@imperial.ac.uk)
- Tim Palmer (ECMWF, UK. Tim.Palmer@ecmwf.int)
- David Roos (UPenn, USA. droos@sas.upenn.edu)
- Julio A. Urbina (IVIC, Venezuela. jurbina@imac.com)
Patrocinantes
- American Society for Microbiology
- Cátedra Simón Bolívar 2006 en e-Ciencia
- Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas (IVIC)
- Centro Nacional de Cálculo Científico Universidad de Los Andes (CeCalCULA)
- Pan American Health Organization
- Fundación Instituto de Estudios Avanzados (IDEA)
- Universidad Central de Venezuela
Charla sobre e-Ciencia en la UNET, San Cristóbal

15.5.06
II Taller Latinoamericano de Computación Grid

Durante la semana del 24-29 de abril del 2006, se llevó a cabo en la Facultad de Ingeniería, Universidad de Los Andes, La Hechicera, Mérida, el II Taller Latinoamericano de Computación Grid, el I Taller Latinoamericano de EELA y el I Tutorial Latinoamericano de EELA. Estos talleres contaron con 21 expositores internacionales, 66 participantes de toda Latinoamérica y el apoyo de varias instituciones incluyendo la Cátedra Simón Bolívar de la Fundación Venezolana de Promoción del Investigador (FVPI). El propósito fundamental de este evento fue mostrar el impacto de las tecnologías grid en la e-ciencia, los avances que han tenido los grids computacionales y su vinculación con diferentes áreas como el almacenamiento de datos, la visualización científica y la colaboración a distancia. El programa de actividades duró una semana (6 días, de lunes a sábado). El primer día se plantearon una serie de conferencias sobre los proyectos y experiencias tanto en EEUU como Europa. Las conferencias el segundo y tercer día se dedicaron a las aplicaciones y al desarrollo de aplicaciones en ambientes de Grid. El cuarto día cubrió las herramientas para manejar enormes volúmenes de datos. El último día se centró en cómo los Grid están afectando la colaboración entre los grupos de investigación, las formas de generación de conocimiento, y cómo están impactando la visualización e imagenología científica.
Expositores
- Giuseppe Andronico, INFN, Italia, giusseppe.andronico@ct.infn.it
- Gabriel Aparicio Pla, UPV, España, gabappla@gmail.com
- Roberto Barbera, INFN, Italia, roberto.barbera@ct.infn.it
- John Boisseau, TACC, EEUU, boisseau@tacc.utexas.edu
- Tonny Calanducci, INFN, Italia, tony.calanducci@ct.infn.it
- Yudith Cardinale, USB, Venezuela, yudith@ldc.usb.ve
- Claudio Cherubino, INFN, Italia, claudio.cherubino@ct.infn.it
- Juan González, IVIC, Venezuela, jugonzal@ivic.ve
- Vanessa Hamar, CeCalCULA, Venezuela,,vanessa@ula.ve
- Emilio Hernández, USB, Venezuela, emilio@usb.ve
- Marcia Inger, TACC, EEUU, minger@tacc.utexas.edu
- Raúl Isea, CeCalCULA, Venezuela, risea@cecalc.ula.ve
- Gregory Johnson, TACC, EEUU, johnson@tacc.utexas.edu
- Guilles Mathieu, IN2P3/CNRS, Francia, gilles.mathieu@in2p3.fr
- Claudio Mendoza, IVIC, Venezuela, claudio@ivic.ve
- Gonzalo Merino, PIC, España, merino@ifae.es
- Yubiryn Ramírez, CeCalCULA, Venezuela, yubiryn@ula.ve
- Luis Rodríguez, IVIC, Venezuela, lsrodriguezt@gmail.com
- Freddy Rojas, CeCalCULA, Venezuela, rfreddy@ula.ve
- Warren Smith, TACC, EEUU, wsmith@tacc.utexas.edu
- Maylett Uzcátegui, CeCalCULA, Venezuela, maylett@cecalc.ula.ve
Participantes
- Francisco J. Acosta Ochoa, Venezuela
- Jesús Aguilar, Venezuela, jota82@cantv.net
- Longendri Aguilera, Cuba, loge@uci.cu
- Alejandro Alvarado, Venezuela, aalvarado@imf.ing.ucv.ve
- César Arismendi, Venezuela, cesararismendi@gmail.com
- Iván Bernal, Ecuador, bernal_carrillo@hotmail.com
- Jesús Campos, Venezuela, jcampos@upel.edu.ve
- Wilson Castaño, Colombia, wcguis@yahoo.com
- Martín Alonso Castillo, Colombia, ingmac11@gmail.com
- Juan Luis Chaves, Venezuela, juanluis@cecalc.ula.ve
- Giancarlo Colmenares, Venezuela, giancarlo.cs@gmail.com
- Einar Coutín, Venezuela, einarc@cecalc.ula.ve
- Violetta D'Addario, Venezuela, violetta@usb.ve
- Rafael Dávila, Venezuela, rdavila@funvisis.gob.ve
- Gilberto Díaz, Venezuela, gilberto@ula.ve
- Carlos Figueira,Venezuela, figueira@usb.ve
- Eric Gamess, Venezuela, egamess@kuaimare.ciens.ucv.ve
- André Gerhard, Brasil, agerhard@usp.br
- Anibal Ghanem, Venezuela, anghanem@yahoo.es
- Iliana C. Gómez Z., Mexico, iliana@cencar.udg.mx
- Leonardo González, Venezuela, Leonardo_G@hotmail.com
- Herling González A., Colombia, herling@tux.uis.edu.co
- Alejandro González García, Cuba, alex@cubaenergia.cu
- Juan A. González P., Venezuela, jugonzal@ivic.ve
- Christian Grunfeld, Argentina, cmg@fisica.unlp.edu.ar
- Glemarys Hernández, Venezuela, glemarys@cnti.gob.ve
- Alvaro Hernández, Venezuela, horence@gmail.com
- Roel José Herrera Palacios, Venezuela,
- Diana Hortua, Colombia, dianahortua@gmail.com
- Yoel Jeréz, Venezuela, jjerez@cnti.gob.ve
- Stephanie Klarica, Venezuela, klarica@ula.ve
- Luis G. León, Venezuela, luisgleon@gmail.com
- Rafael León, Venezuela, leonza99@gmail.com
- Luis A. Maldonado, Venezuela, luissm@cantv.net
- Amador Marín, Venezuela, progr_amador84@yahoo.es
- Reynaldo Mayol, Venezuela, mayol@ula.ve
- Zulay Virginia Méndez Pérez, Venezuela,
- Erick Meneses, Colombia, erickmeneses@gmail.com
- Laudin A. Molina, Venezuela, laudin.molina@gmail.com
- Henry Ricardo Mora, Cuba, ricardo@cubaenergia.cu
- Diana Morales A., Venezuela, anaidlu83@gmail.com
- Noel Moreno Lemus, Cuba, noel@uci.cu
- Juan Morocho, Ecuador, jcmorocho@utpl.edu.ec
- Ricardo H. Nonaka, Brasil, nonaka@usp.br
- Martijn Oldenhof, Venezuela, martijn.oldenhof@gmail.com
- Lilibeth Orjuela, Venezuela, lorjuela@unet.edu.ve
- Marielisa Peralta, Ecuador, mpvalarezo@utpl.edu.ec
- Rafael J. Pérez S., Venezuela, rpsantos@unet.edu.ve
- Demetrio Rey, Venezuela, drey@uc.edu.ve
- Javier E. Rivero, Venezuela, jrivero@idea.gob.ve
- Emely Rodríguez, Venezuela, erg242@hotmail.com
- Henry Rodríguez, Venezuela, hajrodrigue@gmail.com
- Luis S. Rodríguez T., Venezuela, lsrodriguezt@gmail.com
- Carlos D. Rosado, Colombia, carlos.rosado@yahoo.es
- Nicolás Ruíz, Venezuela, nicolas@ula.ve
- Mayerling Sánchez, Venezuela, mayerling@gmail.com
- Yosandra Sandoval, Venezuela, yosandra@cesma.usb.ve
- Nelson Segueri Altuve, Venezuela, nelsonsegueri@hotmail.com
- Juan F. Serrano, Venezuela, jfserranom@kuaimare.ciens.ucv.ve
- Elizabeth Sierraalta, Venezuela, esierralta@cnti.gob.ve
- José D. Texier, Venezuela, jtexier@unet.edu.ve
- Rossana Timaure, Venezuela, rttg@unet.edu.ve
- Edgar Vásquez, Venezuela, evasquez@unet.edu.ve
- Edistio Verdecia M., Cuba, edistioyoel@gmail.com
- Nelson T. Yunaka, Brasil, yunakaof@usp.br
- Matías Zabaljáuregui, Argentina, matiasz@info.unlp.edu.ar
3.4.06
Taller de Herramientas para Análisis de Secuencias
- Mayrí Díaz, Instituto de Biología Experimental, UCV, mayriale@yahoo.com
- Carolina Cortés, Instituto de Biología Experimental, UCV, paranoia_16@hotmail.com
- Lourdes Arteaga, UE Nuestra Sra. de Lourdes II, abraarte@yahoo.com
- Marlene Salazar, Instituto de Altos Estudios en Salud Dr. Arnoldo Gabaldón, marlenenesalazarcorredor@yahoo.com
- Rafael Puche, Instituto de Investigaciones Biológicas, LUZ, rpucheq@gmail.com
- Yurasí Briceño, Universidad del Zulia, yurabri01@yahoo.es
- Mailis Maes, Instituto de Biomedicina, mailis_maes@gmail.com
- Adriana D'Alessandro, Instituto de Biomedicina, adrianamdh@hotmail.com
- Victoria Sánchez, La Universidad del Zulia, sanchezvic@gmail.com
- Mónica García Petit, La Universidad del Zulia, mogapetit27@yahoo.com
- Eliana Nohemí Márquez, Universidad de Los Andes, elianams@ula.ve
- Leia Shuhaibar, La Universidad del Zulia, leiashuhaibar@yahoo.com
- Germán González M., Universidad de Carabobo & IVIC, germangm@cantv.net
- María Victoria Otaiza, Universidad de Carabobo, mv_otaiza@hotmail.com
- Dayana C. Araujo R., Universidad de Carabobo, dayanacaraujo@yahoo.com
- Elvira Sánchez, Universidad de Carabobo, arivell@hotmail.com
29.3.06
Instituciones participantes
El Centro Nacional de Cálculo Científico Universidad de Los Andes (CeCalCULA) es el Laboratorio Nacional para la Experimentación en Ciencias e Ingenierías Computacionales. Se constituye para desarrollar servicios y entrenamiento de personal en Ciencias e Ingenierías Computacionales, así como también aplicaciones a todas las áreas. Ha sido desarrollado a través de un esfuerzo mancomunado entre la Universidad de Los Andes, Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Tecnológicas (CONICIT, ahora FONACIT), y la Corporación Parque Tecnológico de Mérida (CPTM), con la estrecha cooperación de la IBM de Venezuela, Sun Microsystem, y Silicon Graphics. Es el primero de una red nacional de centros de servicios descentralizados de valor agregado, que buscan concentrar esfuerzos y recursos (financieros, equipos y humanos), racionalizando su uso y permitiendo estándares computacionales internacionales bajo las condiciones nacionales de crisis crónicas. CeCalCULA provee facilidades de computación de alto rendimiento (equipamiento, aplicaciones y consultoría) que no podrían ser financiadas por universidades y centros de investigación en forma independiente. Adicionalmente, cohesiona y apoya proyectos de investigación y desarrollo transdisciplinarios que requieran la utilización intensiva del computador como herramienta.
CEMVICC
El Centro Multidisciplinario de Visualización y Cómputo Científico de la Universidad de Carabobo (CEMVICC) fue aprobado por el Consejo Universitario de la Universidad de Carabobo el 18 de marzo del 2005. Trabaja para formar investigadores éticos, íntegros, analíticos y críticos que aporten soluciones tecnológicas eficaces a problemas mediante la investigación científica y aplicada, el soporte a cursos de pre- y post-grado y el trabajo inter, multidisciplinario e interinstitucional. Conforman un equipo que trabaja con integridad y compromiso en la búsqueda de soluciones a problemas científicos y tecnológicos que requieran cómputo de alto rendimiento, visualización de datos y/o la construcción de modelos matemáticos.
Laboratorio de Inmunoparasitología
El Laboratorio de Inmunoparasitología del Centro de Microbiología y Biología Celular del IVIC se aboca al estudio del paludismo por Plasmodium vivax y a la esquistosomiasis mansoni. Las investigaciones atañen a la biología de estos parásitos y su interacción con el huésped humano y sus vectores respectivos, moquitos (Anopheles) y caracoles (Biomphalaria); también al desarrollo y mejoramiento de nuevos métodos para el diagnóstico y vigilancia epidemiológica de estas enfermedades en el área endémica de Venezuela y al estudio de moléculas de P. vivax y S.mansoni con potencial en la vacunación contra estos parásitos. La asociación de la Cátedra Simón Bolívar de e-Ciencia con este Laboratorio, específicamente en el área de bioinformática, se llevará a cabo en el contexto de un curso Internacional de Parasitología Avanzada planificado para las semanas del 24 de julio al 4 de agosto del 2006, y está destinado a investigadores y personal de salud pública de América Central y del área del Caribe.
Programa de la Cátedra de e-Ciencia 2006
Fundación Venezolana de Promoción del Investigador
Cátedra Simón Bolívar 2006 en e-Ciencia
Claudio Mendoza (IVIC)
Actividades programadas
1. Taller de herramientas de análisis de secuencias
Universidad de Los Andes
Mérida, 27-31 marzo 2006
2. II Taller latinoamericano de computación grid
Universidad de Los Andes
Mérida, 24-28 abril 2006
3. Curso sobre tecnología de clusters
Universidad de Carabobo
Valencia, 13-16 de junio 2006
4. Taller de herramientas de análisis de secuencias
Universidad de Los Andes
Mérida, 4-8 septiembre 2006
5. Basic course on host-parasite interactions and
vector biology (seccion de bioinformatica/SIG)
IVIC
Caracas, 3-15 de septiembre 2006
6. Taller de herramientas de análisis de secuencias
Universidad de Carabobo
Valencia, 7-10 de noviembre 2006
7. Se planifican conferencias magistrales sobre e-Ciencia
en: UNET (San Cristóbal), UDO (Cumana), LUZ (Maracaibo),
UNEXPO/UNEG (Puerto Ordaz)

